bsd4me
Well-Known Member
Hallo,
ich habe da so eine Linux Software von Nanopore: "guppy" - läuft auf meinem PC und auf dem Server scheinbar ohne probleme:
[user@server:bin] % ./guppy_aligner
Usage:
guppy_aligner -i <input fastq path> -s <output SAM path>
--align_ref <reference file>
leider in einer jail nicht - in der jail kommt:
[user@jail:bin] % ./guppy_aligner
./guppy_aligner: error while loading shared libraries: libboost_date_time.so.1.66.0: cannot open shared object file: No such file or directory
ok - da gibt es ein lib verzeichnis mit den libraries:
[user@jail:bin] % setenv LD_LIBRARY_PATH /home/user/appl/guppy/ont-guppy-cpu/lib
[user@jail:bin] % ./guppy_aligner
terminate called after throwing an instance of 'boost::filesystem::filesystem_error'
what(): boost::filesystem::read_symlink: No such file or directory: "/proc/self/exe"
Abort (core dumped)
naja - geht nicht - hat jemand eine Idee warum??
Danke! Norbert
ich habe da so eine Linux Software von Nanopore: "guppy" - läuft auf meinem PC und auf dem Server scheinbar ohne probleme:
[user@server:bin] % ./guppy_aligner
Usage:
guppy_aligner -i <input fastq path> -s <output SAM path>
--align_ref <reference file>
leider in einer jail nicht - in der jail kommt:
[user@jail:bin] % ./guppy_aligner
./guppy_aligner: error while loading shared libraries: libboost_date_time.so.1.66.0: cannot open shared object file: No such file or directory
ok - da gibt es ein lib verzeichnis mit den libraries:
[user@jail:bin] % setenv LD_LIBRARY_PATH /home/user/appl/guppy/ont-guppy-cpu/lib
[user@jail:bin] % ./guppy_aligner
terminate called after throwing an instance of 'boost::filesystem::filesystem_error'
what(): boost::filesystem::read_symlink: No such file or directory: "/proc/self/exe"
Abort (core dumped)
naja - geht nicht - hat jemand eine Idee warum??
Danke! Norbert