Installation des UCSC Genome Browsers :-)

[bsd4me]

Hallo,

vielleicht ist jemand daran interessiert den UCSC Genome Browser mit einem einfachen Kommando local auf einem PC/Server unter FreeeBSD (am besten in einer Jail) zu installieren (und zu upgraden)? Ich habe dazu bereits Kontakt zu UCSC und die werden das in Zukunft online stellen. Aber für denjenigen, die mal schauen möchten: www.bioinformatics.uni-muenster.de/download/ucsc. Es ist nicht perfekt - aber vielleichtt gibt es ja ein paar Bioinformatiker, die das interessiert :-)

Viele Grüße, Norbert

 

[h^2]

Hey Norbert,

benutzt ihr bei euch Unipro Ugene? Ich maintaine nämlich den Port, nutze das Programm aber nicht mehr und würde es gern an jemand abgeben, der sich drum kümmern will. Die ganzen letzten Updates hat danfe@freebsd immer eingespielt, deswegen habe ich schon ein schlechtes gewissen -.- Der Port ist sehr einfach (keine patch-files, keine Abhängigkeiten außer bash)!

Gruß,
h^2

 

[bsd4me]

Hallo h^2,

wir nutzen ugene (noch) nicht... und bisher habe ich noch keinen Port betreut - würde ich generell aber gerne mal machen... :-)

VG Norbert

 

[NaWi]

Schöne Software für die BSD's.