Das Problem mit der Maus habe ich mittlerweile selbst gelöst:
Über eine Google-Suche fand ich einen Thread in einem Ubuntu-Forum, wo das gleiche Problem beschrieben war: Es lag an dem 1.32-point-release. Der Fix ist im 132b-point-release. Und ja, die Performance scheint die gleiche zu sein, habe ein VIA KT133A mit AthlonTB C 1GHz 512MB RAM, Gforce3TI200 und zocke auf 1280x1024 mit höchster Deteilstufe und bemerke keinen Unterschied. Eine FPS-Messung habe ich allerdings nicht gemacht. Wie geht die überhaupt?
Außerdem liegt die Stärke von FreeBSD u.a. auch darin, daß man nahezu ohne Performance-Verlust Linux-Programme laufen lassen kann, vielleicht sogar im Einzelfall noch schneller als unter Linux selbst. Natürlich wäre mir nativ lieber, aber wenn es dann kein Punkbuster gibt...
Und wenn es nach mir ginge, dann sollten sowieso alle games out of the box auf FreeBSD laufen, mit offizieller EAX3-Unterstützung von Creative, dann würde ich definitiv auf Windows scheißen!